审计报告是具有审计资格的会计师事务所的注册会计师出具的关于企业会计的基础工作是不是满足会计制度，企业的内控制度是否健全等事项的报告，是对财务收支、经营成果和经济活动全面审查后作出的客观评价，其审计过程应当遵守中国注册会计师审计准则第1501号、1301号等。
司法鉴定是指在诉讼活动中鉴定人运用科学技术或者专门知识对诉讼涉及的专门性问题做鉴别和判断并提供鉴定意见的活动，其检验判定的过程受《全国人民代表大会常务委员会关于司法鉴定管理问题的决定（2015修正）》、《司法鉴定执业分类规定(试行)》、《人民检察院司法会计工作细则（试行）》约束。
第一、主体基本相同。司法会计鉴定和审计的主体有着职业的重合，司法会计师、会计师、审计师、注册会计师均可成为二者的主体，但独立审计往往只能由注册会计师来实施。同时二者均是被动式的活动，往往二者的主体均不具有开展活动的决定权，均受司法机关或有关部门的指派委托开展活动。
第二、依据基本相同。二者的依据都是财务会计资料（会计凭证、会计账簿、财务会计报告等）和反映财务情况、经营成果的情况资料，通过对其资料做审核、检查，从而对有关数据来进行验证。
第三、审计过程基本相同。二者主要使用的标准是财务会计的处理方法和审计的检查、查询、计算、分析性复核等方法，以获得相应的结论。
鉴定报告与审计报告即使如此相似，审计报告却不能作为合法的证据，主要有以下原因：
首先，司法鉴别判定机构是司法鉴定人的执业机构，经省级司法行政机关审核登记，取得《司法鉴定许可证》，在登记的司法鉴别判定业务范围内，开展司法鉴别判定活动。司法鉴别判定人应当具备本办法规定的条件，经省级司法行政机关审核登记，取得《司法鉴定人执业证》，按照登记的司法鉴定执业类别，从事司法鉴别判定业务。而根据《会计师事务所执业许可和监督管理办法（财政部令第89号）》会计师事务所应当自领取营业执照之日起60日内，对所在地的省级财政部门申请执业许可。取得执业许可证的会计师事务所，同时从事司法会计鉴定的，应取得《司法鉴别判定许可证》，且从业人员应持有《司法鉴定人执业证》。从实践情况去看，会计事务所通常不具有司法鉴定资质，这是在刑事案件中控辩双方都容易忽略的问题。
其次，审计报告在执行审计工作的基础上，仅仅对财务报表发表审计意见，并制作书面文件，严格意义来讲，审计报告只属于书证，而根据司法会计鉴定属于鉴定意见，正常的情况对于书证的质证，只能依据客观文书记载内容、形式发表质证意见，对于专业的会计问题辩护人、公诉人、审判人员可能都无法甄别，导致没办法有效质证，而鉴定意见，根据《中华人民共和国刑事诉讼法》规定，经控辩双方申请，或法院决定，能要求鉴定人出庭接受询问，有利于发掘案件真相，公平公证审理。
最后，审计报告与司法会计鉴定是两个不同的范畴，不能以审计报告代替司法鉴定书。会计师事务所出具的审计报告，审计机构就特定目的进行专项审计得出的结论，并非诉讼过程中就查明事实的专门性问题由具备资格的鉴定人提出的鉴定意见，不具备司法会计鉴定的证明作用，当然也就不能作为认定事实的证据。
